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国際ワークショップ「生物情報資源の相互運用性」

International Workshop on the Interoperability of Biological Information Resources (IBIR)

主催 国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター・データベース運用開発研究室
支援 科学技術振興機構バイオインフォマティクス推進事業

  概 要
 
   
開催日 3月17日(金曜日)
会場 新宿パークタワー
参加費
無料
申込方法
>>こちらからお申し込みください。  [終了]
申込締切日
定員になり次第締切り
問い合わせ先
国立遺伝学研究所
生命情報・DDBJ研究センター データベース運用開発研究室
e-mail:symp060317@genes.nig.ac.jp
 
◆趣 旨
   2006年のNucleic Acids Researchのデータベース特集号には、2005年版から139件増えて858件が収録されている。ここに収録された情報資源はそれぞれ広く利用されている。一方で、一定の研究目的のために、情報資源の開発者とは異なる切り口での利用や、複数の情報資源を組合わせた利用が試みられている。
 こうした複合利用は、Webブラウザーでウインドウを次々に開いて複数の情報資源を渡り歩くことで可能ではある。しかし、大量のデータを効率よく解析する ために、一連のデータ操作をプログラムから自動的に処理したくなる。
 このため、近年、WebサービスGRIDによるデータベースの連携利用がバイオ分野でも広がっており、分散した複数のWebサービスのメソッドを組合わせたワークフローも工夫されてきている。しかし、異なるサイトのメソッドを自動的に連携させていくことは未だ困難である。
 そこで、BioMOBY、myGRID、バイオグリッドなど、異種のバイオ情報資源の相互運用性を実現してさまざまな目的のために分 散したバイオ情報資源の統合利用に取り組んでいるグループによるプロジェクトの紹介を受け、「生物情報資源の相互運用性」の将来を展望する。
 
◆プログラム
 
10:00-10:10 開会の挨拶
10:10-10:55 Timothy B. Patric University of Wisconsin, US
"Three Dimensions of Interoperability"
Presentation data
11:00-11:45 松田秀雄 大阪大学
"Data Integration of Life Sciences using Grid Technology"
Presentation data
11:45-13:00 昼食
13:00-13:45 Duncan Hull University of Manchester
"Data Integration in myGrid with Taverna"
Presentation data
13:50-14:30 菅原 秀明 国立遺伝学研究所
"Application of Biological Web services to Workflows at a Sequence Databank"
Presentation data
14:30-15:15 Dan Rosauer National Heritage Assessment,
Australia
Bryn Honeyman National Pollutant Inventory,
Australia
"Mapping Biogeographic Patterns from Species Occurrence Data - the Biodiversity Analysis Tool"
Presentation data
15:15-16:30 デモンストレーション
16:30-16:40 閉会の挨拶


関連リンク
BioMOBY University of Wisconsin-Milwaukee Timothy B Patrick
myGRID University of Manchester Duncan Hull
Biodiversity Analysis Tool National Heritage Assessment,Australia Rosauer Dan
National Pollutant Inventory,Australia Honeyman Bryn
バイオグリッド 大阪大学 松田秀雄
バイオWebサービス 国立遺伝学研究所 菅原秀明




国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター データベース運用開発研究室  e-mail:symp060317@genes.nig.ac.jp    FAX:055-981-6896